El 1 de octubre de 1999 se traspasan a la Comunidad Foral las funciones y servicios de la Administración del Estado en materia de provisión de medios materiales y personales para el funcionamiento de la Administración de Justicia en Navarra.

Con ese fin se crea la Dirección General de Justicia dentro del ámbito del Departamento de Presidencia, Función Pública, Interior y Justicia.